提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
冬日洗车有讲究******
交管部门提示,近期受天气、温度等因素影响,车主在洗车时要多加注意,避免本想“护车”最后却变成“伤车”。
午间适宜洗车
冬天洗车需要“看天行事”,如达到结冰温度,最好别洗。建议选择晴朗天气洗车,有利于洗车后蒸发残留水分,避免出现车身结冰的情况。如果时间允许,建议选择中午时段,这是一天中气温最高的时段。同时,建议等发动机冷却下来,尤其是雪后,因为刚熄火的车辆,发动机附近的车身温度较高,如用冷水冲洗,会造成车身急速降温,对车漆的损伤较大。所以,最好静置5分钟至10分钟再冲洗。
选择温水洗车
冬季的温度较低,建议使用温水洗车。一是车辆长时间行驶后,车身温度较低,如用冷水洗车,容易出现结冰的情况,可能对车漆造成损伤;二是车辆经过雨雪路段后,车身、底盘、轮毂等部位容易沾上腐蚀性物质,温水的去污能力较强,可以清理这些物质。
此外,用高压水枪冲洗车辆时,不要对着锁孔或车门、后备厢盖的接缝处长时间喷洗,也不要对着密封条、软管、轮胎等易损坏部件冲洗,否则容易造成这些隐蔽的地方积水后结冰或损坏。冬季应尽量避免冲洗发动机舱,由于发动机舱内温度高,即便是温水也会有较大的温差,很可能损伤内部零件。
洗后吹干缝隙
车辆清洗后,除擦干车身上的水,还要将车窗、门把手、雨刮器、后备厢等位置缝隙里的水擦干净。需要提醒的是,洗车后不要马上使用手刹,因为刹车线上可能有水,在低温下容易结冰,使得刹车线失去弹力,很难复位。所以,最好行驶一段时间再驻车拉手刹。最重要的是,车辆洗完后,可以驾车在道路上行驶一段时间,利用风将残留的水分吹干以及车辆本身产生的热量将水分烘干。(记者胡智伟)